Uporaba javno dostopnih podatkov za analizo presežne umrljivosti v 1. valu epidemije COVID-19 v Italiji

Event Date: 
Friday, 18 December, 2020 - 14:00
Location: 
online
Lecturer: 
izr. prof. dr. Lara Lusa

Eden ključnih izidov pri oceni dejanskih učinkov epidemije COVID-19 je presežna umrljivost. Kot mero presežne smrtnosti lahko vzamemo enostavno razmerje med pričakovanim in opazovanim številom smrti in zanemarimo vzrok smrti, ki je lahko nenatanko določen ali celo sporen.

Temeljni problem pri uporabi obstoječih metod predstavljajo dostopni podatki, ki so zbrani v agregirani obliki in objavljeni z večmesečnim zamikom. Italijanski statistični urad (Istat) se je odločil za pohitritev postopka objave podatkov med epidemijo, vendar pa so podatki objavljeni na začetku aprila vsebovali samo občine, kjer je bila umrljivost vsaj 20% večja glede istega obdobja v letih 2015-19. Ker ne gre za slučajni vzorec občin, bi bilo relativno tveganje smrti v letu 2020 na združeni ravni močno precenjeno. Metodologijo za analizo na podlagi nepopolnih podatkov smo prilagodili z uporabo teorije permutacijskih testov in identificirali italijanske province s presežno umrljivostjo v primerjavi z istim obdobjem v prejšnjih letih. Konec maja so bili naknadno objavljeni podatki še za vse preostale občine, kar nam je omogočilo neposredno validacijo in evalvacijo naših metod.

Na dopolnjenih podatkih smo uporabili tudi metode, ki so bile predlagane za razvrščanje simbolnih podatkov. Uporaba metodologije je pripomogla k razumevanju različnih trendov, ki so se pojavili tako časovno kot geografsko v širjenju epidemije. Razvrščanje je temeljilo na krivuljah relativnega tveganja za smrt v 13 tednih na ravni provinc; vključeni so bili prebivalce, ki so bili stari vsaj 60 let. Tedenske podatke provinc smo razvrstili v pet skupin. Pri dveh smo opazili zelo visoko ali visoko presežno umrljivost, razlikovali pa sta se tudi glede ocenjenih oblik krivulj (skupno delo z Natašo Kejžar).

Povezava na videokonferenco:

Topic: Biostatisticni center - Lara Lusa's Zoom Meeting
Time: Dec 18, 2020 01:45 PM Budapest

Join Zoom Meeting
https://upr-si.zoom.us/j/86366310191
 

About IBMI

Institute for Biostatistics and Medical Informatics (IBMI), formerly Institute for BioMedical Informatics (so still IBMI) was founded by the Faculty of Medicine as a result of a need for a unit which would perform, or coordinate, tasks related to data analysis and providing information, relevant for research in medicine. The programme of the institute, and its development, have been adjusting thorugh time to changes in financing and technological progress, but the basic aim remain the same: to support research in medicine. This is achieved through the following tasks:

Contact

Institute for Biostatistics and Medical Informatics
University of Ljubljana, Faculty of Medicine
Vrazov trg 2, 1000 Ljubljana
Slovenia

tel: +386 1 543-77-70
fax: +386 1 543-77-71
email: ibmi (at) mf.uni-lj.si